Целью данной работы было генотипирование Mycobacterium
tuberculosis путем определения шести локусов VNTR (MIRU10,
MIRU26, MIRU31, MIRU39, MIRU40, ETR-A) и определение особенностей генотипа штаммов M. tuberculosis с лекарственной устойчивостью у больных туберкулезом.
Локусы MIRU10, MIRU26, MIRU40 и ETR-A проявили высокий
полиморфизм в группе non-Beijing, локусы MIRU26 и MIRU31 -- в
семействе Beijing. Комбинированное определение шести локусов -
MIRU10, MIRU26, MIRU31, MIRU39, MIRU40 и ETR-A - для генотипирования как среди изолятов группы Beijing, так и среди группы nonBeijing было высоко эффективным. Поэтому генотипирование M.
tuberculosis по 6-ти локусам может рассматриваться как более простая альтернатива определению 24 локусов.
Среди изолятов семейства Beijing преобладали такие кластеры, как 355335, 355344, 355345, 356335, 356344, 375334, 375344,
385345, 385334. Кластеры 355335, 375334 и 385334 имели высокий
уровень мультирезистентности и мутаций в генах katG и rpoB.
Среди изолятов в группе non-Beijing наиболее распространенным
кластером был 452242, который вместе с кластером 712234 характеризовались высоким уровнем мультирезистентности и высокой
частотой одновременных мутаций в генах katG и rpoB. Среди ВИЧ инфицированных наиболее распространенными кластерами были
в семействе Beijing 375344 и в группе non-Beijing — кластер 553213.
The aim of the study was to obtain a genetic profiles of
Mycobacterium tuberculosis through detection of six VNTR-loci
(MIRU10, MIRU26, MIRU31, MIRU39, MIRU40, ETR-A) and to determine the peculiarity of the genotype of drug-resistant M. tuberculosis strains in tuberculosis patients.
Loci MIRU10, MIRU26, MIRU40 і ETR-A have exhibited high
polymorphism in non-Beijing group, while loci MIRU26 and MIRU31
— in Beijing family. It was highly effective to detect the combination of six loci - MIRU10, MIRU26, MIRU31, MIRU39, MIRU40 і ETR-A
— of Beijing and non-Beijing strains for their genotyping. That’s
why the genotyping of M. tuberculosis by 6 loci can be proposed as
more simple alternative for detection of 24 loci.
Among Beijing family isolates there were such dominant clusters as 355335, 355344, 355345, 356335, 356344, 375334, 375344,
385345, 385334. Clusters 355335, 375334 and 385334 had high
level of multi-resistance and mutations in katG and rpoB genes. The
most spreading cluster among non-Beijing isolates was 452242
which along with cluster 712234 had high level of multi-resistance
and mutations in katG and rpoB genes. Among HIV-infected
patients the most prevalent cluster from Beijing family was 375344
and from non-Beijing group — cluster 553213.
